当致病因素作用于角膜时，角膜缘血管网会充血，炎症细胞进入角膜基质和病灶表面，引起角膜水肿。在病灶不侵犯基质而局限于上皮层的情况下，如果病情被控制，角膜可以恢复透明；如果病情发展，在组织内压和细菌毒素的双重作用下，角膜基质组织坏死脱落，形成角膜溃疡，此时即使疾病治愈，浅层溃疡被填满，也会留下厚薄不一的永久性瘢痕。若溃疡继续向深部发展，则会引起角膜部分的全层坏死而穿孔。

    角膜之所以容易形成溃疡和穿孔与其组织结构有很大关系。角膜中无血管，血液中的抗体和炎症细胞不易到达病灶区控制炎症，这是主要原因。角膜组织结构单一、薄弱、暴露于体表，易被破坏而脱失；前弹力层和基质层再生修复能力差也是重要的原因。